Pendaftaran siswa baru SMA Muhammadiyah 5 Jakarta dilakukan melalui website resmi sekolah maupun langsung datang ke sekolah. Berikut adalah syarat dan ketentuan yang harus dipenuhi pada saat penyerahan kelengkapan berkas pendaftaran siswa baru:
1. Calon pendaftar harus melampirkan Foto Copy ijazah SMP/Sederajat Legalisir
2. Calon pendaftar harus melampirkan Foto Copy Surat Keterangan Lulus
3. Calon pendaftar harus melampirkan Foto Copy Kartu Keluarga dan AKTE
4. Calon pendaftar juga harus melampirkan foto 2x3 (4 lembar), 3x4 (4 lembar) dan 4x6 (4 lembar)
5. Pendaftar yang sudah menginput data mengkonfirmasi kepada panitia yang tercantum untuk proses lanjutan.
6. Membayar Biaya Uang PPDB (Boleh Lunas juga boleh dicicil sesuai dengan ketentuan yang berlaku)